Magneesium võib mõjutada mõnede ravimite imendumist või toimimist, näiteks teatud antibiootikumid, kilpnäärme ravimid ja mõned retseptiravimid. Seetõttu soovitatakse hoida magneesiumi ja ravimite vahel vähemalt 2-tunnist vahet.
Enamasti on magneesium ohutu koos ravimitega, kuid alati on soovitatav konsulteerida arstiga, kui võtad regulaarselt retseptiravimeid.